Protein–RNA interactions for Protein: A2AIW0

Sdccag3, Serologically defined colon cancer antigen 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag3A2AIW0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sdccag3A2AIW0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sdccag3A2AIW0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms