Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms