Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDB2

4930469K13Rik, RIKEN cDNA 4930469K13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930469K13RikA0A286YDB2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
4930469K13RikA0A286YDB2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930469K13RikA0A286YDB2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
4930469K13RikA0A286YDB2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930469K13RikA0A286YDB2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930469K13RikA0A286YDB2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930469K13RikA0A286YDB2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930469K13RikA0A286YDB2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930469K13RikA0A286YDB2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930469K13RikA0A286YDB2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930469K13RikA0A286YDB2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms