Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYE2

Trbv3, T cell receptor beta, variable 3 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv3A0A0A6YYE2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv3A0A0A6YYE2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv3A0A0A6YYE2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv3A0A0A6YYE2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv3A0A0A6YYE2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv3A0A0A6YYE2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv3A0A0A6YYE2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv3A0A0A6YYE2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv3A0A0A6YYE2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv3A0A0A6YYE2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv3A0A0A6YYE2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv3A0A0A6YYE2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv3A0A0A6YYE2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv3A0A0A6YYE2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv3A0A0A6YYE2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv3A0A0A6YYE2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv3A0A0A6YYE2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv3A0A0A6YYE2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv3A0A0A6YYE2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv3A0A0A6YYE2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv3A0A0A6YYE2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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