Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WRF5

Gm20792, Predicted gene 28891, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20792A0A087WRF5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20792A0A087WRF5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20792A0A087WRF5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20792A0A087WRF5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20792A0A087WRF5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms