Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Ssx9-201ENSMUST00000103001 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm8600-201ENSMUST00000186320 905 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 1700066N21Rik-201ENSMUST00000190123 783 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 4930402F11Rik-201ENSMUST00000207348 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Slfn8-203ENSMUST00000108152 3083 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Olfr469-202ENSMUST00000213252 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm14443-201ENSMUST00000109054 4516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Zfp534-201ENSMUST00000117638 2885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Olfr483-201ENSMUST00000104917 1065 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm5943-201ENSMUST00000119458 459 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm5123-201ENSMUST00000121905 837 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm12226-201ENSMUST00000144172 876 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm5755-201ENSMUST00000152394 837 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm23753-201ENSMUST00000157575 149 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm17421-201ENSMUST00000167845 674 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Vmn1r139-202ENSMUST00000173668 753 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Mir6413-201ENSMUST00000184049 108 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm27893-201ENSMUST00000184408 194 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Olfr745-201ENSMUST00000062534 1175 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm22155-201ENSMUST00000083836 162 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm42446-201ENSMUST00000199783 3284 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Lztfl1-201ENSMUST00000026274 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 AC155830.1-201ENSMUST00000220050 3836 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Prkdc-201ENSMUST00000023352 12647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm28240-201ENSMUST00000187560 2053 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Zfp990-201ENSMUST00000105741 3044 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Olfr395-202ENSMUST00000215690 4275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm14518-201ENSMUST00000117351 542 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm13698-201ENSMUST00000178325 732 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm13694-202ENSMUST00000178655 732 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm13696-201ENSMUST00000179311 732 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm13693-202ENSMUST00000179448 732 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm13695-202ENSMUST00000179504 732 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm13697-202ENSMUST00000179552 732 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 4930428D20Rik-201ENSMUST00000201886 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 AC165164.1-202ENSMUST00000219324 649 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 AC163621.2-201ENSMUST00000222229 682 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 AC134864.1-201ENSMUST00000226326 511 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Mir215-201ENSMUST00000083628 112 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Srek1-204ENSMUST00000210489 6330 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Olfr992-203ENSMUST00000214895 2222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Olfr111-203ENSMUST00000215424 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Olfr706-202ENSMUST00000213918 4828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Wfdc18-201ENSMUST00000001009 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm13874-201ENSMUST00000130680 809 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm19726-201ENSMUST00000205008 240 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Cyp2b26-ps-201ENSMUST00000206238 1090 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 AC118230.1-201ENSMUST00000220196 656 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Tmed11-201ENSMUST00000004943 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Olfr1477-201ENSMUST00000214274 3913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Vmn1r217-202ENSMUST00000227110 9888 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm14684-201ENSMUST00000145722 123 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm22849-201ENSMUST00000157713 307 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm8906-202ENSMUST00000179375 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm22979-201ENSMUST00000082609 159 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 A330044P14Rik-201ENSMUST00000176108 2706 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm5346-201ENSMUST00000056023 2326 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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PtprtQ99M80 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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PtprtQ99M80 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
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PtprtQ99M80 Gm5926-201ENSMUST00000177740 711 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm38075-201ENSMUST00000191979 920 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm33093-201ENSMUST00000197751 790 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Sprr2h-201ENSMUST00000059845 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Mirlet7c-1-201ENSMUST00000083623 94 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Zfp992-201ENSMUST00000105733 4550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Cfh-206ENSMUST00000192880 3746 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Xist-201ENSMUST00000127786 17769 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Trbv13-1-201ENSMUST00000103268 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Trav12d-2-201ENSMUST00000103593 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Trav12n-2-201ENSMUST00000103619 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm14714-201ENSMUST00000119743 439 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm21842-201ENSMUST00000177552 498 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm21626-201ENSMUST00000177791 498 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm21562-201ENSMUST00000177888 498 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm21539-201ENSMUST00000177925 498 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm17469-201ENSMUST00000177942 498 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm17693-201ENSMUST00000178004 498 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm17361-201ENSMUST00000178121 498 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm17522-201ENSMUST00000178144 498 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm21599-201ENSMUST00000178249 498 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm21616-201ENSMUST00000178416 498 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PtprtQ99M80 Gm21914-201ENSMUST00000178452 498 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
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