Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Fam107b-206ENSMUST00000176254 300 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Olfr781-201ENSMUST00000075613 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Olfr948-201ENSMUST00000076516 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Olfr1290-201ENSMUST00000099616 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Olfr639-202ENSMUST00000215653 6570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Olfr1120-202ENSMUST00000215163 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Olfr389-201ENSMUST00000122224 3057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Olfr629-203ENSMUST00000216300 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Gm11576-201ENSMUST00000117433 417 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Gm12677-201ENSMUST00000118668 426 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Gm14714-201ENSMUST00000119743 439 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprmP28828 1700010H22Rik-202ENSMUST00000187592 1003 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Rhoay-ps3-201ENSMUST00000187648 576 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Gm37490-201ENSMUST00000195566 724 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprmP28828 AC149586.1-201ENSMUST00000222647 645 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprmP28828 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Olfr744-201ENSMUST00000066457 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Cacnb4-202ENSMUST00000102760 7872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Prkdc-201ENSMUST00000023352 12647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Gm40909-202ENSMUST00000223275 5564 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Drr1-202ENSMUST00000151575 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Olfr1459-202ENSMUST00000213493 8854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Slitrk6-201ENSMUST00000078386 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Xist-201ENSMUST00000127786 17769 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Vmn1r185-207ENSMUST00000227695 5292 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Gm13873-201ENSMUST00000119208 427 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprmP28828 2210408F21Rik-206ENSMUST00000138653 417 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Gm20688-201ENSMUST00000176779 512 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Gm20777-201ENSMUST00000177818 699 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Gm20873-201ENSMUST00000179410 699 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Gm20737-201ENSMUST00000179665 699 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Gm21310-201ENSMUST00000180130 699 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Gm29365-201ENSMUST00000189461 699 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprmP28828 9530022L04Rik-201ENSMUST00000194340 310 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Gm44972-201ENSMUST00000206419 406 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Gm45037-201ENSMUST00000207475 673 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprmP28828 AC171203.1-201ENSMUST00000215363 456 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprmP28828 AC127371.1-201ENSMUST00000228516 312 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Gm26129-201ENSMUST00000082719 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Snord35b-201ENSMUST00000082833 87 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Gm45149-201ENSMUST00000206459 2172 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Gm44542-201ENSMUST00000208677 4314 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Olfr1180-203ENSMUST00000217320 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Gm43341-201ENSMUST00000200104 1308 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Mrgprx2-201ENSMUST00000098433 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Gm37862-201ENSMUST00000193079 2533 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PtprmP28828 2810474O19Rik-208ENSMUST00000189837 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Gm23791-201ENSMUST00000122553 293 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Gm29668-201ENSMUST00000187802 315 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Igkv2-113-201ENSMUST00000196138 362 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Gm43214-201ENSMUST00000199242 352 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Gm9845-201ENSMUST00000056409 598 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Xrn1-202ENSMUST00000185633 10256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Olfr1034-201ENSMUST00000213496 4882 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PtprmP28828 C87499-203ENSMUST00000107143 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Cfhr1-201ENSMUST00000023965 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Olfr630-201ENSMUST00000106880 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Gm8989-201ENSMUST00000184782 7275 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Gm16216-201ENSMUST00000118970 1111 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Gm15022-201ENSMUST00000122074 746 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprmP28828 4930405D11Rik-201ENSMUST00000132218 568 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Olfr367-ps-202ENSMUST00000143957 942 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Gm4222-201ENSMUST00000165784 470 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Gm27783-201ENSMUST00000183534 105 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Gm42621-201ENSMUST00000198114 275 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Gm42428-201ENSMUST00000198677 302 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Gm19596-201ENSMUST00000203685 739 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprmP28828 AC153954.2-201ENSMUST00000213811 287 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprmP28828 AC173115.1-201ENSMUST00000220835 211 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Gm4945-201ENSMUST00000075152 453 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Vmn1r89-204ENSMUST00000227239 1992 ntAPPRIS P2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PtprmP28828 Akap4-201ENSMUST00000057101 2851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm42949-201ENSMUST00000197054 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm37456-201ENSMUST00000193176 5837 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm37645-201ENSMUST00000194285 3556 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Mid2-203ENSMUST00000112993 5916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Olfr361-202ENSMUST00000214969 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm43191-201ENSMUST00000140672 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm12976-202ENSMUST00000153817 412 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Vmn1r-ps34-201ENSMUST00000174046 943 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PtprmP28828 Gm18342-201ENSMUST00000186987 694 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
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