Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upk1bQ9Z2C6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms