Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psmb3Q9R1P1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psmb3Q9R1P1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psmb3Q9R1P1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Psmb3Q9R1P1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Psmb3Q9R1P1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Psmb3Q9R1P1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Psmb3Q9R1P1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Psmb3Q9R1P1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Psmb3Q9R1P1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Psmb3Q9R1P1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms