Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lamc3Q9R0B6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lamc3Q9R0B6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lamc3Q9R0B6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lamc3Q9R0B6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Lamc3Q9R0B6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lamc3Q9R0B6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lamc3Q9R0B6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lamc3Q9R0B6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lamc3Q9R0B6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lamc3Q9R0B6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Lamc3Q9R0B6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lamc3Q9R0B6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms