Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gpc6Q9R087 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms