Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChmQ9QXG2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChmQ9QXG2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms