Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Trim44Q9QXA7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim44Q9QXA7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms