Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ap3b2Q9JME5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap3b2Q9JME5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms