Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
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SacsQ9JLC8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
SacsQ9JLC8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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SacsQ9JLC8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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SacsQ9JLC8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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SacsQ9JLC8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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SacsQ9JLC8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
SacsQ9JLC8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms