Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dap3Q9ER88 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dap3Q9ER88 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms