Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC50

Crot, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrotQ9DC50 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CrotQ9DC50 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrotQ9DC50 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms