Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Swt1Q9DBQ9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Swt1Q9DBQ9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms