Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lin37Q9D8N6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lin37Q9D8N6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lin37Q9D8N6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lin37Q9D8N6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lin37Q9D8N6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lin37Q9D8N6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lin37Q9D8N6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lin37Q9D8N6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lin37Q9D8N6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lin37Q9D8N6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lin37Q9D8N6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lin37Q9D8N6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lin37Q9D8N6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lin37Q9D8N6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lin37Q9D8N6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lin37Q9D8N6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lin37Q9D8N6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lin37Q9D8N6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lin37Q9D8N6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lin37Q9D8N6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lin37Q9D8N6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lin37Q9D8N6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lin37Q9D8N6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lin37Q9D8N6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lin37Q9D8N6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lin37Q9D8N6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lin37Q9D8N6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lin37Q9D8N6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lin37Q9D8N6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lin37Q9D8N6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lin37Q9D8N6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lin37Q9D8N6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lin37Q9D8N6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lin37Q9D8N6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms