Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Y3

Rhox2a, Reproductive homeobox 2A, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2aQ9D4Y3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhox2aQ9D4Y3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhox2aQ9D4Y3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhox2aQ9D4Y3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhox2aQ9D4Y3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhox2aQ9D4Y3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rhox2aQ9D4Y3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhox2aQ9D4Y3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms