Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gcc1Q9D4H2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gcc1Q9D4H2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms