Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clvs1Q9D4C9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms