Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed11Q9D2R4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed11Q9D2R4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed11Q9D2R4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed11Q9D2R4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed11Q9D2R4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed11Q9D2R4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed11Q9D2R4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed11Q9D2R4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed11Q9D2R4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed11Q9D2R4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed11Q9D2R4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed11Q9D2R4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed11Q9D2R4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed11Q9D2R4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed11Q9D2R4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed11Q9D2R4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed11Q9D2R4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed11Q9D2R4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed11Q9D2R4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed11Q9D2R4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed11Q9D2R4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed11Q9D2R4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed11Q9D2R4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed11Q9D2R4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed11Q9D2R4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed11Q9D2R4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed11Q9D2R4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed11Q9D2R4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed11Q9D2R4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed11Q9D2R4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed11Q9D2R4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed11Q9D2R4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed11Q9D2R4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed11Q9D2R4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms