Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsig1Q9D2J4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsig1Q9D2J4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsig1Q9D2J4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsig1Q9D2J4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsig1Q9D2J4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsig1Q9D2J4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsig1Q9D2J4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsig1Q9D2J4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsig1Q9D2J4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vsig1Q9D2J4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vsig1Q9D2J4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vsig1Q9D2J4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vsig1Q9D2J4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms