Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms