Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmss1Q9CZT6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmss1Q9CZT6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.1 ms