Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nde1Q9CZA6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms