Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pfdn1Q9CWM4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Pfdn1Q9CWM4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Pfdn1Q9CWM4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Pfdn1Q9CWM4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Pfdn1Q9CWM4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pfdn1Q9CWM4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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