Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS72

Filip1, Filamin-A-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Filip1Q9CS72 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Filip1Q9CS72 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Filip1Q9CS72 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Filip1Q9CS72 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Filip1Q9CS72 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Filip1Q9CS72 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Filip1Q9CS72 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Filip1Q9CS72 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Filip1Q9CS72 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Filip1Q9CS72 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Filip1Q9CS72 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Filip1Q9CS72 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Filip1Q9CS72 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Filip1Q9CS72 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Filip1Q9CS72 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Filip1Q9CS72 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Filip1Q9CS72 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Filip1Q9CS72 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Filip1Q9CS72 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Filip1Q9CS72 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Filip1Q9CS72 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Filip1Q9CS72 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Filip1Q9CS72 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Filip1Q9CS72 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Filip1Q9CS72 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Filip1Q9CS72 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms