Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY8

Tm4sf20, Transmembrane 4 L6 family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf20Q9CQY8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tm4sf20Q9CQY8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms