Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Nicn1Q9CQM0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Nicn1Q9CQM0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nicn1Q9CQM0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nicn1Q9CQM0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nicn1Q9CQM0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nicn1Q9CQM0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nicn1Q9CQM0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nicn1Q9CQM0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Nicn1Q9CQM0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Nicn1Q9CQM0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms