Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ76

Nepn, Nephrocan, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NepnQ9CQ76 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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NepnQ9CQ76 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NepnQ9CQ76 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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