Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtf2a1Q99PM3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtf2a1Q99PM3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms