Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rrbp1Q99PL5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rrbp1Q99PL5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rrbp1Q99PL5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rrbp1Q99PL5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rrbp1Q99PL5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rrbp1Q99PL5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rrbp1Q99PL5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rrbp1Q99PL5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rrbp1Q99PL5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rrbp1Q99PL5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rrbp1Q99PL5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rrbp1Q99PL5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rrbp1Q99PL5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rrbp1Q99PL5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rrbp1Q99PL5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rrbp1Q99PL5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rrbp1Q99PL5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rrbp1Q99PL5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rrbp1Q99PL5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rrbp1Q99PL5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rrbp1Q99PL5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rrbp1Q99PL5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rrbp1Q99PL5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rrbp1Q99PL5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rrbp1Q99PL5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rrbp1Q99PL5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rrbp1Q99PL5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rrbp1Q99PL5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rrbp1Q99PL5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rrbp1Q99PL5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rrbp1Q99PL5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rrbp1Q99PL5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rrbp1Q99PL5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rrbp1Q99PL5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rrbp1Q99PL5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rrbp1Q99PL5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rrbp1Q99PL5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rrbp1Q99PL5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rrbp1Q99PL5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rrbp1Q99PL5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rrbp1Q99PL5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rrbp1Q99PL5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rrbp1Q99PL5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rrbp1Q99PL5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rrbp1Q99PL5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rrbp1Q99PL5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Rrbp1Q99PL5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms