Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rassf3Q99P51 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rassf3Q99P51 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms