Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcf2Q99LE6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcf2Q99LE6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcf2Q99LE6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcf2Q99LE6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcf2Q99LE6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcf2Q99LE6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcf2Q99LE6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcf2Q99LE6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcf2Q99LE6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcf2Q99LE6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcf2Q99LE6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcf2Q99LE6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcf2Q99LE6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcf2Q99LE6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcf2Q99LE6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcf2Q99LE6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcf2Q99LE6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Abcf2Q99LE6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Abcf2Q99LE6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Abcf2Q99LE6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms