Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CsprsQ99388 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CsprsQ99388 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CsprsQ99388 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CsprsQ99388 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CsprsQ99388 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CsprsQ99388 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CsprsQ99388 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CsprsQ99388 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CsprsQ99388 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CsprsQ99388 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CsprsQ99388 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CsprsQ99388 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CsprsQ99388 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CsprsQ99388 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CsprsQ99388 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CsprsQ99388 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CsprsQ99388 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CsprsQ99388 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CsprsQ99388 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CsprsQ99388 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CsprsQ99388 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CsprsQ99388 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CsprsQ99388 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CsprsQ99388 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CsprsQ99388 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CsprsQ99388 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CsprsQ99388 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CsprsQ99388 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CsprsQ99388 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CsprsQ99388 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CsprsQ99388 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CsprsQ99388 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CsprsQ99388 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CsprsQ99388 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CsprsQ99388 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CsprsQ99388 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CsprsQ99388 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CsprsQ99388 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CsprsQ99388 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CsprsQ99388 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CsprsQ99388 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CsprsQ99388 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CsprsQ99388 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CsprsQ99388 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CsprsQ99388 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CsprsQ99388 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CsprsQ99388 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CsprsQ99388 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CsprsQ99388 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CsprsQ99388 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CsprsQ99388 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CsprsQ99388 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CsprsQ99388 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CsprsQ99388 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CsprsQ99388 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CsprsQ99388 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CsprsQ99388 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CsprsQ99388 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CsprsQ99388 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CsprsQ99388 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CsprsQ99388 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CsprsQ99388 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CsprsQ99388 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CsprsQ99388 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CsprsQ99388 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CsprsQ99388 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CsprsQ99388 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CsprsQ99388 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CsprsQ99388 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CsprsQ99388 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CsprsQ99388 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CsprsQ99388 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CsprsQ99388 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CsprsQ99388 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CsprsQ99388 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CsprsQ99388 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CsprsQ99388 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CsprsQ99388 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CsprsQ99388 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CsprsQ99388 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CsprsQ99388 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CsprsQ99388 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CsprsQ99388 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CsprsQ99388 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CsprsQ99388 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CsprsQ99388 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CsprsQ99388 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CsprsQ99388 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CsprsQ99388 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CsprsQ99388 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CsprsQ99388 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CsprsQ99388 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CsprsQ99388 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CsprsQ99388 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CsprsQ99388 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CsprsQ99388 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CsprsQ99388 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CsprsQ99388 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CsprsQ99388 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms