Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Rnf144aQ925F3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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Rnf144aQ925F3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Rnf144aQ925F3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Rnf144aQ925F3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf144aQ925F3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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