Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atl3Q91YH5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atl3Q91YH5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms