Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Basp1Q91XV3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms