Protein–RNA interactions for Protein: Q91W92

Cdc42ep1, Cdc42 effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep1Q91W92 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdc42ep1Q91W92 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdc42ep1Q91W92 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms