Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppargc1bQ8VHJ7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppargc1bQ8VHJ7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 185.6 ms