Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ubxn4Q8VCH8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ubxn4Q8VCH8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms