Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H1

Slc47a1, Multidrug and toxin extrusion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc47a1Q8K0H1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Slc47a1Q8K0H1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms