Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPAP2Q8IXW5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPAP2Q8IXW5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms