Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Hpf1Q8CFE2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hpf1Q8CFE2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms