Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBG9

Rnf170, E3 ubiquitin-protein ligase RNF170, mousemouse

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Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf170Q8CBG9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rnf170Q8CBG9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf170Q8CBG9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Rnf170Q8CBG9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rnf170Q8CBG9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf170Q8CBG9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf170Q8CBG9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf170Q8CBG9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf170Q8CBG9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf170Q8CBG9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rnf170Q8CBG9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf170Q8CBG9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf170Q8CBG9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf170Q8CBG9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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