Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3B8

Rft1, Protein RFT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rft1Q8C3B8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rft1Q8C3B8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rft1Q8C3B8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms