Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prpf18Q8BM39 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prpf18Q8BM39 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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