Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NfascQ810U3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms